WhatsApp va separa discuţiile purtate cu utilizatorii altor aplicaţii de cele purtate cu utilizatorii WhatsApp, astfel că va exista o listă separată, numită „Third-party chats”, unde vor fi listate discuţiile cu persoane care folosesc alte aplicaţii de comunicare.
Comunicarea cu utilizatorii altor aplicaţii va fi opţională, utilizatorii trebuind să activeze uneori manual această opţiune.